حضرت آیت‌الله خامنه‌ای:

« بهشتى بى‌شک در ايران، در شخصيتهاى سياسى ايران شخصيت اول بود. نه در آن روزى كه شهيد شد؛ از اول اينجور بود. در شوراى انقلاب از اول كار، هنوز قبل از اين‌كه امام تشريف بياورند به ايران و بعد از ورود امام و تشكيل دولت_موقت، آن عنصر محورى مركزى فعال در شوراى انقلاب او بود؛ همه اين را قبول داشتند. بى‌انصاف و ظالم هست اگر كسى از افراد آن روز شوراى انقلاب اين حقيقت آشكار را منكر بشود.»

«امام فرمودند شهید بهشتی مظلوم بود. ما هم یادمان هست که او چقدر مظلوم بود؛ اما این مظلومیت از سوی چه کسانی بر او تحمیل میشد؟ از جمله کسانی که باید پاسخ مظلومیت این شهید عزیز را بدهند، اینهایی هستند که حاضر نبودند قضای اسلامی را در جامعه ایران اسلامی تحمّل کنند.» ۱۳۸۰/۰۴/۰۷

«تصور من از آقاى بهشتى اين است كه گناه نمى كرد… البته نمى خواهم در مقام مبالغه بگويم ايشان معصوم تالى تلو معصوم بود اما مى خواهم بگويم برخوردش با ماها و ارتباطش با دوستان به طورى بود كه گمان گناه را براى او در ذهن معاشرينش خيلى ضعيف مى كند و من تصور مى كنم ايشان اصلا گناه نمى كرد.»

«مگر چند نفر امثال شهید بهشتی یا آن چهره‌های مبارز و آن افراد مخلص و پاکباز، در یک کشور و در میان یک ملت به ظهور میرسند؟ ضربه خیلی سنگین بود، ولی نظام ایستاد.» ۱۳۷۰/۰۴/۰۸